一、行業協會的法律地位沒有明確。從國辦發[2007]36號文件《關于加快推進行業協會商會改革和發展的若干意見》明確提出“加快行業協會立法”兩年多了，至今落實不力，有關工作進展緩慢。
       二、行業協會是獨立的社會法人主體，在憲法和法律法規允許的范圍內開展活動。政府有關部門和任何個人不得在任何時候、任何地點以任何方式和方法干涉行業協會的工作。但目前的管理體制在一定程度上制約了行業協會的進一步改革和發展。如協會“章程”的“統一模式”，抹殺了不同協會的特色；政府有關部門推薦行業協會領導人的操作程序和辦法實際上造成了協會“章程”的虛設，削弱了協會理事會的作用。
       三、行業協會屬于非盈利單位，與企業追求經濟效益最大化的目標不同。因此，現在大多數行業協會都參照事業單位管理，但行業協會卻沒有“人事權”，使行業協會本來就缺乏目標激勵的工作性質變得更加不穩定。
       四、關于行業協會的中央政策與地方政策不銜接、不配套、不協調等問題，使許多應該管的事沒人管：如北京市的工作居住證、女職工的生育險不予辦理。而不應該管的事卻政出多門：如辦理社團的銀行賬戶，中國人民銀行和財政部的政策就不一樣；國家沒有一分錢撥款，卻要列入到中央預算單位。
       五、行業協會的信息工作是其主要職能之一，其話語權在推動行業發展中具有舉足輕重的作用。但行業協會創辦與本行業業務密切相關的專用雜志卻得不到批準。存在的問題是沒有審批標準和行政工作“違憲”。黨中央和國務院面對內需不旺的情況一直在強調發展服務業，但現實情況卻與此背道而馳。
       六、行業協會的“準入”存在壟斷，業務主管部門和登記部門的雙重管理體制已非常不合時宜。近年來，在行業協會的工作實踐中，許多專家就此提出異議；一些開明大度的官員也曾提出改革建議，但不知為什么如此正確的意見就是無人負責落實。最近，大連市行業協會無業務主管單位試點工作和民政部與深圳市簽署《推動民政事業綜合配套改革》的“部市合作協議”堪稱改革的一大亮點。協議明確提出“改革雙重管理體制，探索建立直接登記制度”等一系列重大的改革措施。這是我國社會組織發展史上值得關注的一件大事，對于推動社會組織管理體制改革具有重要的社會意義。
       七、行業協會的稅收制度嚴重不合理，尤其是與企業一樣交納所得稅的政策，使行業協會難以休養生息，缺乏發展后勁，也挫傷了行業協會專職人員的工作積極性。
       八、行業協會的資產歸屬必須明確：既非個人財產，也不是國有資產。應該界定為協會資產，任何權利機關和個人不得隨意處置。如有的行業協會近幾年靠自我發展、自我積累購買的辦公用房在房屋管理部門登記時卻要登記為“國有資產”，不可思議。
       九、關于出臺行業協會的管理政策存在隨意性，“行政許可法”執行不力。幾年前，國資委關于《工商領域行業協會政策環境研究》報告中就提出“行業協會不能以所有制來建立”的政策建議，為業界廣泛認同。但最近全國工商聯獲“行業協會業務主管部門”資格的政策出臺，就令人啼笑皆非。一方面，有關部門在淡化這種雙重管理體制，一方面自己又在否定自己。這不是改革的倒退又是什么？難道這就是“中國特色”，擬或是某位大領導的一時糊涂所致？
       十、對于境外行業協會等組織在我國境內設立辦事處、分會和專業化委員會等機構，應該盡快予以登記，不登記應視為非法組織，不得在我國境內活動。現在的問題是對于這類組織沒有登記管理辦法。造成的直接后果是：對于合法登記的行業協會等組織越管越嚴，甚至管死。而對于不合法登記的所謂協會、學會和商會根本不管，談何管理？這不能不是我國民間組織管理的一大尷尬。
以上十大問題的解決，寄希望于《行業協會法》的早日出臺。